Environment alters epigenome and causes cancer 当講座は千葉大学医学部で昭和42年に開設された生化学第二講座に端を発します。
平成25年に分子腫瘍学と改称し、癌エピゲノム研究を遂行しています。

がんエピゲノム解析セミナー

Galaxyとエクセルを用いてエピゲノム情報の解析原理と基本ステップを学ぶセミナーを月に1度開催しています。
公開セミナーですので、講座外・学外の方含めてどなたでもご参加いただけます。
開催時間:各月の最終金曜日(プレミアムフライデー) 18:00〜20:00
 18:00~19:00 講師によるセミナー(講義or演習)
 19:00~20:00 討論会&懇談会(自由解散)
※演習時は無線LAN通信が可能なノートPCをご持参ください。(ノートPCの貸出は応相談)

連絡先 福世真樹
fukuyo◎chiba-u.jp
予定
日程

形式

セミナー内容

講師

第14回


4/28(金)


講義


エピゲノムの概要
エピゲノム解析手法について

岡部


第15回




5/26(金)




講義+演習




特定領域におけるエピゲノム解析
(プライマー作成、データの可視化)
 パイロシーケンスによるメチル化解析・ChIP-PCRによるヒストン修飾解析
来週以降の演習の準備
高根、杉浦、福世



第16回



6/30(金)



演習



Galaxyを用いた次世代シーケンス解析基礎
(ファイル形式、可視化、クオリティチェック、マッピング)

福世



第17回


7/28(金)


演習


RNA-seqデータの解析法
(マッピング、FPKM計算)

浅川


第18回


8/25(金)


演習


ChIP-seqデータ解析
(マッピング、ピークコール、定量、ブラウザでの可視化)

岡部


第19回


9/22(金)


演習


bedtoolsを使ったNGSデータの統合解析
(遺伝子アノテーションなど)

岡部


第20回


10/27(金)


演習


RNA-seq, Infiniumデータの可視化
(Galaxyを用いたクラスタリング、box plotなどグラフ化)

福世


第21回



11/24(金)



演習



Infiniumデータの解析法
(プローブの抽出、1遺伝子1プローブの選び方、クラスタリング)

松坂



第22回

12/22(金)

演習

RNA-seq, Infinium, ChIP-seqデータの統合解析

岡部

第23回

1/26(金)

講義+演習

統計解析基礎1

福世

第24回

2/16(金)

講義+演習

統計解析基礎2

福世

2016年度